Nato a Milano, Maurizio Salerno si è diplomato in organo e composizione organistica presso il Conservatorio della sua città e in clavicembalo presso i conservatori di Lugano e Torino sotto la guida di Ottavio Dantone. Si è perfezionato presso la Schola Cantorum di Basilea con Jean-Claude Zehnder e in seguito ha studiato con Andrea Marcon.

Come solista svolge un'intensa attività concertistica in Italia e in Europa, ed ha inoltre tenuto concerti negli Stati Uniti, Sud America, Russia e Australia. Insieme al violinista Stefano Montanari ha fondato l'ensemble 'L'Estravagante', con il quale ha registrato opere di Buxtehude, Pachelbel e Bach. Come continuista collabora con prestigiose orchestre europee.

In duo con Edoardo Bellotti ha registrato numerosi cd a due organi per la rivista Amadeus e per Bottega Discantica. Tiene regolarmente corsi presso importanti Accademie e Conservatori di Musica.

E' organista titolare della prestigiosa Basilica di Santa Maria della Passione a Milano.

Insegna organo e composizione organistica presso il Conservatorio di Brescia.