Gardiner ha inciso oltre 250 dischi. Ha fondato il Monteverdi Choir, gli English Baroque Soloists e Orchestre Revolutionnaire et Romantique. Nonostante egli abbia acquisito gran parte della sua fama come interprete della musica barocca su strumenti d'epoca, la sua discografia include un repertorio vastissimo, che spazia dal basso medioevo al Romanticismo e che include le nove sinfonie di Beethoven, la La damnation de Faust di Berlioz ed il Falstaff di Verdi. A titolo di direttore invitato, Gardiner ha diretto le orchestre Philharmonia, Boston, Cleveland, Royal Concertgebouw and Wiener Philharmoniker.